Кукурудзяний глютен має гербіцидні властивості, проте такий контроль не має економічного сенсу

Утім, контроль бур’янів за допомогою кукурудзяного глютенового борошна не завжди ефективний, бо передбачає надзвичайно високі норми внесення — до 2 тонн/га.

Кукурудзяний глютен суттєво не впливає на більшість бур’янів під час їхньої активної вегетації, однак він здатен пригнічувати проростання і розвиток ювенільних рослин.

Глютен, що виділяють ґрунтові мікроорганізми, представлений фітотоксичними ди- і пентапептидами. Точний механізм дії цих олігопептидів невідомий, але є інформація, що вони впливають на утворення клітинної стінки рослин і цілісність мембран.

Таким чином кукурудзяний глютен можна вважати прогербіцидом із повільним вивільненням активних інгредієнтів, оскільки він потребує ферментативного гідролізу.