7 серпня 2018, 15:45, Насіння

Визначено геном сої, що може покращити врожай культури

Дослідження показали, що соя була одомашнена в Китаї приблизно 5000 років тому, а потім вона поширилася по всьому світу. Під час процесу розповсюдження соя зазнала значних генетичних змін у різних географічних регіонах. Американські вчені розшифрували геном сої для свого регіону в 2008 році (Williams 8). Геном сої, латинська назва якої Glycine max, став одним з найскладніших рослинних геномів, розшифрованих на сьогоднішній день. Його довжина становить близько мільярда пар нуклеотидів - приблизно третина від розміру генома людини.

«Наш остаточно зібраний геном становить 1,025 Гб, контиг N50 - 3,46 МБ, а каркас N50 - 51,87 Мб. Наскільки нам відомо, це четвертий геном сої, який до цього часу розшифрували. У порівнянні з раніше використовуваним соєвим еталонним геномом, якість нашого нового зібраного геному значно покращується, він має довшу загальну довжину послідовності, вищий контиг N50 та каркас N50 і менше пробілів», — сказав доктор Янтінг Шень, старший автор цієї роботи.

Більше того, після ретельного порівняння послідовностей геному між Zhonghuang 13 та Williams 82 дослідницька група встановила, що геном Zhonghuang 13 показує велику кількість генетичних варіацій порівняно з Williams 82. У новому геномі було виявлено в загальній складності 36 429 сполучних елементів та 52 051 ген, що кодує протеїн. Автори сподіваються, що цей новий геном сприятиме дослідженню геноміки бобових та поліпшенню врожаю сої.